北京時間7月25日下午15點，亞足聯在總部吉隆坡對本屆亞運會男足賽事進行了重新分組抽簽。中國隊依然是在C組，與伊拉克、敘利亞和東帝汶同組較量。而此前被遺漏的巴勒斯坦隊和阿聯酋隊分別被抽入A組和E組。

實際上，在7月5日亞組委就已經完成了亞運會男足抽簽，當時中國隊與伊拉克隊、敘利亞隊和東帝汶隊同分在一個小組。不過，由于報名參賽的阿聯酋隊和巴勒斯坦隊并未出現在分組抽簽的結果名單之中，引起兩國奧委會強烈不滿，直接向印尼亞運會組委會以及亞奧理事會進行抗議，而兩國足協也直接與亞足聯展開溝通。

幾經協商后，印尼組委會提出了將阿聯酋和巴勒斯坦隨機抽簽，分入此前已經抽好的小組中。最終，根據2018年印尼雅加達亞運會男足比賽最新分組出爐，此前被遺漏的巴勒斯坦隊和阿聯酋隊分別被抽入A組和E組。

同時，26支球隊將仍保持此前既定的六個小組，其中小組賽六個小組賽中，第二、三、四和六小組將每個小組有4隊，而第一和第五小組將各有5隊。由于阿聯酋和巴勒斯坦隊的加入，整個賽程與賽制也相應地進行了調整。第一小組和第五小組的比賽將從8月10日展開，而其他四支球隊的小組首輪一檔球隊輪空，將從8月12日的第二輪比賽開始打起。

在晉級規則上，依然是每組前兩名以及四支成績最好的小組第三晉級。其中，在成績最好的小組第三名的比拼中，五支球隊所在小組會自動去除第三名與墊底球隊的交鋒戰績。由于小組對手沒有發生變化，中國隊的備戰不會受到太大影響。最新消息顯示，中國隊確定在8月5日和9日分別與馬來西亞和伊朗隊熱身，且中國隊征戰印尼雅加達亞運會的27人名單也已經正式出爐。

雅加達亞運會男足分組結果（重抽）——

A組：印度尼西亞隊、中國香港隊、老撾隊、中國臺北隊、巴勒斯坦隊（增補）；

B組：泰國隊、烏茲別克隊、孟加拉隊、卡塔爾隊；

C組：伊拉克隊、中國隊、東帝汶隊、敘利亞隊；

D組：日本隊、越南隊、巴基斯坦隊、尼泊爾隊；

E組：韓國隊、吉爾吉斯隊、馬來西亞隊、巴林隊、阿聯酋隊（增補）；

F組：朝鮮隊、沙特阿拉伯隊、伊朗隊、緬甸隊。